首页 软件产品 真空去雄 育种实用统计学 申请试用 博思公益 联系我们  
 

 

BLUP育种值遗传评估服务

 

 BLUP育种值分析,在植物领域作为一项新的分析技术方法,引起了不少育种者的关注和重视,可以预见的是,很快BLUP育种值分析软件会成为植物领域不可或缺的分析工具。博思公司开发了“农博士分子平台软件”,提供BLUP分析功能给用户使用。但是由于BLUP理论和技术方法学习难度大,分析要求高,对育种数据整理有严格要求,使得植物育种者使用BLUP分析面临很大的挑战。

BLUP分析过程,可能遇到的问题和挑战包括:

1、对电脑要求高,配置高的电脑,无疑更适合BLUP分析,会节约分析时间。

2、对操作者要求高,熟悉电脑操作,熟悉育种,熟悉BLUP分析方法和分析流程,熟悉线性混合模型,软件各项分析参数的选择和确定。

3、对软件要求高。不同格式的数据,可能导致软件无法顺利运行;数据量巨大,软件很可能运行不了,需要从开发层面调整软件运行参数;软件分析时间过长,需要依据数据调整优化软件运行模式。

4、数据格式问题,数据错误问题,数据适合性问题,系谱数据正确性等,都可能影响到软件的顺利运行。

考虑各种可能情况,我们考虑对外提供BLUP育种值数据分析服务。

数据分析对象:

动植物种类不限:玉米、小麦、白菜、苹果、猪、牛、鱼等等。

数据来源不限:即不论数据来自某个试验或者就是积累的育种数据均可。分子数据可以直接采用质控后的GWAS数据。客户应提供试验数据的情况说明文档。

数据日期不限:近期的数据,多年的数据都可以。

BLUP育种值分析,对育种数据本身没有试验设计要求。但是如何选用数据还是要结合用户数据具体情况具体分析。

提供分析支持包括:

 1、基于系谱的BLUP育种值分析

 2、基于分子测序分型结果的ssGBLUP(一步法)分析服务(分子数据,我们不提供质控分析,仅提供BLUP分析)

服务流程简介:

 1、用户提供育种数据,与我司签订数据保密协议,保证用户数据安全;

 2、博思公司进行专业数据分析工作,时间通常为7个工作日,视数据量和分析难度商定。

 3、结果交付客户,并对分析结果给出育种操作性建议,让客户看懂结果,明白结果如何使用。

 

介绍一下,更高水平的BLUP育种值遗传评估:

 

在全国范围内评价一个育种材料的育种价值,可以这么做

 

以玉米为例,我们将蓝玉米育种材料分析软件中的系谱,结合用户手头系谱,用于玉米BLUP育种值分析,就可以在全国范围玉米品种内进行遗传评估。

玉米采用蓝玉米育种材料分析软件的玉米系谱作为大系谱(收录了1946-2023年间25991个玉米品种系谱数据)

小麦采用小麦育种材料分析软件的小麦系谱作为大系谱(收录1963到2022年间7150个小麦品种系谱数据)

水稻采用农博士育种材料分析软件(水稻)中的水稻系谱作为大系谱(收录14671个通过审定的水稻品种系谱数据)

这样,育种者手头的材料系谱+我们提供的作物大系谱,借助BLUP育种值分析技术,就可以将育种者手头的育种材料放到全国范围内该作物更大的遗传背景下,对材料进行遗传评估。

BLUP育种值遗传评估工作,基于客户提供的数据进行BLUP育种值遗传评估,给出遗传评估分析报告,作物种类不限。其中玉米、小麦、水稻3种作物可结合我们的作物大系谱数据进行分析,服务报价会高一些。

遗传评估详细介绍请参阅公众号文章《在全国范围内评价一个育种材料的育种价值,可以这么做》。

如果您感兴趣,请跟博思公司联系。欢迎咨询了解更多信息。微信:13651031258

 

下载:

32位版本 64位版本

如果仅使用BLUP功能,点上方链接,下载就可以了。文件大小6M左右。

关于农博士软件误报病毒木马的说明.pdf

完整软件安装包下载(含分子演示数据,文件较大152M)

 

软件及服务购买和使用答疑及软件交流探讨等事宜,请扫描下方微信二维码

 

 

服务电话: 13651031258 13641337315 010-88435130