农博士-以知识、技术、管理推动我国农业科技进步
诞生于2004年,做贴合中国育种实际需要的育种数据采集管理分析系统。

-=农博士育种家软件介绍=-

新增 BLUP AB群育种分析功能
 

博思公司的农博士育种家软件(NBSbreeding)一直在开发完善更实用更有价值的软件功能,服务众多软件用户。继自主成功开发BLUP育种值(breeding value)线性混合模型分析方法后,前段时间又进一步推出了REML方差组分估计功能,刚刚过去的70周年国庆,博思公司技术人员一直在工作岗位加班加点,不负众望,( BLUP  AB 育种)(GCA)功能开发成功。NBSbreeding不断完善自身功能,我们写文章建议植物育种领域要重视育种值应用,用育种值提升一般配合力分析水平,是考虑,植物育种在数据分析领域需要向动物育种借鉴成熟的数学分析方法。作为一款专业的植物育种软件,我们也会把BLUP跟一般配合力(GCA)结合的线性混合模型分析技术开发出来给软件用户使用。我们会推荐建议,但我们一定提供给用户多样选择。我们就是为育种用户服务的。配合力的计算如果按照配合力公式,真是小学生都可以完成的计算,过于简单了。所以一直猜测,国际种业大公司不会这样简单的使用配合力,这不,一种复杂的BLUP 配合力分析模型就来了。
   y =μ+ Xβ+ Ua + Wb + Zs + e

μ:试验数据均值
β
:年度+地点的合并固定效应
a
A群一般配合力向量
b
B群一般配合力向量
s
:测配组合A×B特殊配合力向量
e
:剩余误差向量
X
UWZ
为相应关联矩阵。

我们根据植物育种特点,参考Rex Bernardo教授及王健康老师介绍的模型,结合植物育种数据特点,提出了上述数学模型,更适合AB群模式育种使用。(2019.10.06)


新增 REML
分析 功能

REML(Restricted Maximum Likelihood)限制性最大似然估计英文首字母的缩写,也有称约束最大似然法,其主要功能是线性混合模型中的方差组分估计。
BLUP计算需要知道分析性状的加性遗传方差,因此在进行BLUP分析前,需要先用REML进行方差组分估计,或者采用经验值。REML是比BLUP更加复杂的计算过程。主要有两种计算方式,求导方式和非求导方式(如:DFREML算法)。NBSbreeding两种方式都提供支持。 (2019.9)

 

BLUP育种值分析服务

自北京中农博思科技发展有限公司在国内倡导,植物育种选择使用育种值(breeding value)以来,引起了众多育种单位育种工作者的积极关注,农博士育种家软件持续升级,增强对BLUP育种值计算的支持,为了方便育种单位使用BLUP育种值分析方法,博思公司正式推出面向植物育种的数据分析服务。

用户提供数据文件和系谱文件,博思公司专业技术服务人员,就可以为用户进行BLUP育种值数据分析服务。2019.8.2 详情

玉米系谱研究分析及SS-NSS分析算法

     72年跨度玉米系谱研究成果及系谱研究思路方法揭秘,农博士主动公布蓝玉米软件功能实现技术路径,为推动国内系谱大数据利用,为玉米育种技术进步,尽绵薄之力。《蓝玉米育种材料分析软件使用手册》PDF

分子育种GBLUP育种值分析

    博思公司倡导植物育种中采用育种值用于育种选择,并依据常规育种系谱,在育种家软件中提供BLUP育种值分析方法,考虑客户现实需要,博思公司在育种家软件中新增加了GBLUP育种值计算分析功能。具备全基因组选择(GS)试验条件的用户,可以进行两种BLUP育种值计算分析,综合比较分析结果,为育种选择提供更准确的参考信息。GBLUP是全基因组选择(GS)中计算材料育种值的一种算法。GBLUP采用分子标记(SNP)信息建立试验材料间的亲缘关系G矩阵,相比依托育种系谱建立的加性遗传相关矩阵A,理论上更能准确的反应材料间的基因相似程度。GBLUP是传统BLUP育种值分析方法在分子育种领域的延伸。
 

做育种的同时还承担国家区域试验任务,怎样实现便捷管理?
育种联合体试验数据采集汇总怎么办?
本单位+外单位区域布点试验数据采集、汇总、分析一体化解决方案

     育种单位承担国家区域试验任务,或者联合体育种试验,提供品种测试服务的单位试验数据的采集、上报、管理、分析,生成最终报告,内容杂,环节多,牵扯面广,令不少用户头疼,博思公司新推出解决方案,感兴趣的朋友,请跟博思公司了解咨询。
 

一年多点区域试验免费在线缺区检验
博思公司开发的免费在线检验程序。适用于一年多点试验,根据缺区发生位置,在线检验试验数据是否可以进行方差分析。

品种稳定性分析新增相对平均偏差RSD支持

     相对平均偏差(RSD,Relative Standard Deviation)可以度量稳定性试验中材料间的数据离散程度,比方差、Shukla方差度量分辨效果更好。为方便用户使用及比较,稳定性分析同时增加Shukla模型稳定性方法支持。
 1、相对平均偏差RSD应用于一个试验中品种间稳定性的比较;
 2、稳定性分析模型(Y=μ+年度效应+地点效应+积温效应+σ),应用于品种适宜推广地区的定位分析。
农博士育种家软件为育种后期,材料稳定性评价、品种适合推广区域定位提供专业统计分析支持。
查看相关文档:
相对平均偏差在品种稳定性分析中的作用.pdf

Eberhart-Russell模型、Shukla模型、相对平均偏差稳定性分析比较.pdf
   免费在线算RSD

育种专用条码设计及打印支持

     育种软件提供育种专用条码、普通条码的设计及打印功能。

多作物育种支持

     一套软件可以管理多种作物同时育种。每种作物的育种性状可以自定义。采集器配套软件同步支持多作物,支持多任务同时采集。

新增品种稳定性分析功能

     采用博思公司自主研制的品种稳定性分析理论和方法,将传统分析方法中基因X环境互作效应用更合理的积温及其它因素细化替代,能够更科学合理地反应品种的生产表现。参见《论品种稳定性分析.pdf》

种质库模块重大升级

     根据客户反馈意见,种质库模块进行了重大升级,更好地实现了育种数据模块与种质库模块的数据交流共享,支持种质检索。2016.1

移动育种数据采集系统(安卓Android)

     应广大用户要求,博思公司正式推出基于Android(安卓)系统的育种移动数据采集系统,有需要的用户可以联系。2015.10

新增分子育种MAS/GS数据分析支持

     提供完整的分子育种与实际育种选择工作的结合,从分子育种试验群体效应计算,到依据分子标记效应预测材料表型值,进行育种选择。

新增α-Lattice(α-格子设计)试验设计及数据分析支持

     α-格子试验设计,是当前国外育种企业采用的一种不完全区组试验设计,主要应用于育种过程中早、中期产量试验阶段的品种筛选。其采用的不完全区组的试验设计方式,提升了试验效率,降低了育种试验成本。与随机区组试验设计相比,在参试材料很多的情况下,随机区组的小区面积急剧扩大,地块地力差异,对试验本身产生了破坏性影响,或者可以表述为,试验设计的局部控制失灵。在不扩大试验地块面积的情况下,尽量多安排试验材料,这就是不完全区组试验设计的优越性。

NBSBreeding API Ver1.0

   农博士育种家软件二次开发应用程序接口正式发布,Ver1.0包括41个接口函数,功能涵盖了,育种年度、性状、材料、权限、系谱、杂交、统计、图像等多个模块,对正式版用户免费提供。网站仅提供API手册下载。NBSBreeding API Ver1.0手册》下载

植物BLUP育种值估计预测

    育种家软件基于博思公司研制的BLUP植物育种值模型,成功实现了支持多性状育种值预测的软件功能,使用软件,在选育自交系、常规育种以及配置杂交组合的关键环节可以准确把握材料的育种值,准确把握育种方向,将实质性改变植物育种现状。详情参阅《博思育种2014》

育种产量相关性状结构指数

    博思公司根据我国育种家工作需要,自行研制的育种应用指数,该指数实现了育种性状的综合数值化目标,指数的高低可以用于度量育种材料的产量潜力,是通过性状数值化描述育种材料产量潜力的新工具。 育种家软件自2013.11.04日新版本起将提供该指数计算功能。

在线免费使用

玉米   小麦   水稻
指数详细介绍(pdf)


软件购买后终身可以使用,无时间限制,数据存储在用户自己的内部服务器上
 



 

主要功能特点:
  • 育种数据采集---管理---分析,一体化的大型育种软件系统。
  • 集成移动设备,条码技术,提升数据采集效率,降低数据错误,方便育种工作。
  • 将数量遗传学、生物统计、遗传学研究成果,与育种数据分析相结合,在用户传统经验育种基础上,轻松导入及应用先进科学的育种分析方法。定性定量相结合,服务育种工作。
  • 育种数据管理分析,育种试验设计,育种试验分析,育种数据采集,统计分析,图像识别,多种功能集一身。
  • 可自定义育种考察性状,目前已成功应用于玉米、小麦、水稻、谷子、高粱、番茄、西(甜)瓜、辣椒、油菜、甘蔗、花卉等30多种植物育种领域。
  • 通过质量性状分级转换,将分级质量性状等同数量性状,一并参与数值计算,极大提升了育种数据利用价值。
  • 调查文本数据与拍摄照片集成管理,看调查数据同时可看所拍摄照片,支持数码相机同步工作。
  • 照片导入,照片浏览管理维护,图像识别,植株特征识别提取,叶夹角、长宽比、高度、面积、周长、考种计数等功能。株型育种支持。采用sqlserver系列数据库,支持海量数据存储。
    籽粒特征提取动画演示
  • 支持自交系选育管理,系谱动态生成。
  • 支持杂交材料管理,支持系谱管理。
  • 动态试验设计,对比法、间比法、完全随机、随机区组、条区、裂区、拉丁方,常用方差分析,配合力分析,一年多点,多年多点,遗传模型检验等育种分析方法。除此之外,并在数据管理环节内部直接集成诸多统计分析功能,使统计分析应用直接结合数据浏览,统计知识的育种指导应用简单直接,目前集成的统计功能主要有:
    A、质量性状次数分布(分布图)
    B、常用统计量自动计算(方差,标准差,变异系数,平均数等)
    C、质量性状分级显示
    D、品种评价 / 选择淘汰 / 关联度
    E、杂交组合试配(电脑上搞杂交,杂交组合预测)
    F、BLUP
    G、配合力分析
     
  • 杂交组合鉴定管理,方便查看参配材料在组合中表现,看一份材料在所有参配组合的平均表现。
  • 杂交组合预测功能,根据已有杂交组合数据,科学计算预测新组合生产表现,“在电脑上搞组合杂交”,优化育种计划,提高育种效率。
  • 支持Internet环境下使用,异地远程数据实时汇总,特别适合在外地有育种点,在海南有加代基地,有合作单位承担试验报数据使用。
  • 严密的人员权限管理,课题组或者育种组有权限制约实现数据共享,组长可授权查看组员数据,组员仅能查看自己的数据。可设置浏览权限,仅能浏览数据,不能更改数据。
  • 育种服务器上的育种家移动采集模块可与移动采集设备无缝对接,工作人员田间采集数据可直接存储到育种服务器,只要有Internet上网连接的地方,都可随时提交采集数据(比如海南岛试验田里采集设备GPRS上网)
  • 采集数据任务化,育种负责人在育种家软件中定义采集任务,工作人员通过采集设备接收任务,采集完毕,上报数据。
  • 移动育种数据采集+条码扫描,是当今国际育种最先进工作模式,极大提高育种数据采集效率,高效、准确、可减轻育种工作人员的繁重工作,节省宝贵时间
  • 育种家软件注重育种数据保密性,无论是人员权限还是育种数据采集环节,这种保密性可传递到贵单位的整个育种技术体系。
  • 目前,部分国家级、省级农科院所、农业高校和一批知名种业企业已成为育种家软件忠实用户。

 

“育种数据管理第一重要”


    “民以食为天,农以种为先”,育种工作的重要性是不言而喻的, 大家都十分清楚。种子企业每年有大量的人员、资金投入到育种科研工作中去, 就为了能育出好品种,大品种。在追求品种的过程中,育种数据信息是最重要的。很多种子公司,包括大型种业企业,在育种数据的管理、汇总、分析、利用上有明显的不足和落后,育种信息化是很多大型种业企业急需解决的课题。没有先进的育种数据管理系统,就实现不了现代商业育种。
   没有数据积累的育种,是没有前途的育种。
   国际同行早就在使用计算机进行育种科研工作了,这是当前育种一线前沿传递给我们的信息,典型的例子,大家都知道先锋、先正达在用电脑搞育种,我们的电脑用的是Excel进行一些数据管理和处理工作,但显然,国际同行使用的是专门的育种软件,Excel仅是一个office办公电子表格处理软件,我们的育种工作落后了 。

   手工记录,方式落后,效率低
    中国目前的育种工作,大多停留在田间手工记录在本子(田间记载本)上的阶段,这样就需要,二次数据整理和录入工作,易出错,数据整理工作量大,数据采集滞后。 甚至出现,历史育种数据成为垃圾数据的糟糕局面。
   育种工作保密性急需加强
    手工采集方式,决定了额外的技术工人培训指导,育种工作几无保密性可言,技术工人管理、使用存在一系列衍生问题。制约育种工作的顺利开展。
   育种工作缺乏有力手段实现数据及时汇总
    手工采集的方式,很难保证及时的数据汇总工作,这样就很难保证育种工作 进度的完成,从全局考虑,增大了育种工作管理的难度。数据报不上来,数据分析利用,制订下一步育种计划都要受影响。
   育种工作急需加强数据分析利用工作
    数据的采集是为了数据的分析和利用,很多人谈到国内育种工作的水平时会谈及“经验”二字,这让我们多少有些难堪,个人搞育种凭经验,我们商业化育种也靠经验,那就是一件大事了。有的老师会将用Excel进行育种数据管理当做实现了育种信息化,以为用Excel分类汇总,查找材料,就是利用电脑进行育种数据分析了,甚至我们就快赶上先锋、先正达的育种技术水平了,这真是很肤浅。
    我们拍摄了那么多的材料照片,利用上却没有好的办法,比如:我们看一个材料在多个年代中的田间性状表现的图片,无法实现。因为Excel没有提供这样的功能。这需要专业的育种数据管理软件来实现。再比如:需要从历年材料中筛选出符合某些条件的材料,我们也没有办法实现。因为我们的数据是分放在不同Excel表单文件中的。北京中农博思科技发展有限公司提出了一个重要的育种理念:“育种数据管理第一重要”,只有开展了科学扎实的育种数据管理工作才能进行更方便和更高水平的数据分析利用工作,在推广农博士育种家的同时,我们也在 宣传这个理念。

    育种工作需要配备高效信息采集设备
    先正达的育种人员田间采集数据使用的是一种移动采集设备,不少国内的育种老师知道了这一情况。农博士育种家的移动采集终端基于Windows Mobile平台自主开发实现,与农博士育种家软件无缝链接,实现了田间一次数据采集,全部育种数据集中汇总的应用水平。极大提升了育种工作的效率,减轻了育种工作量。
 

 

农博士育种软硬件系统集成服务(BSI)

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