-=农博士育种家软件介绍=-

 

1、软件联系育种实际需要，为客户自动解决统计方法适用问题：很多统计分析方法，在育种实际应用中是需要选择性使用和联系育种实际情况而决定如何使用的，可以上升为育种中的统计应对策略也可以简化为一个软件参数选项，我们在该款育种软件中，充分考虑了可能遇到的数据情况进行了策略性的编程处理。比如一年多点的布点品种试验仅有一个观测值数据，软件自动按照单因素随机区组试验进行方差分析。又比如，育种数据常有缺区情况，采用统计参数调整的方式应对缺区分析（实测发现SAS9.1就是这样分析的，点击查看详情：农博士育种家与SAS统计软件数据分析结果比较.pdf），而不是采用缺区估值方式处理等。2018年，我公司正式出版的《育种实用统计学》一书，对育种中可能遇到的类似情况进行了更多的分析并给出了应对策略。免费电子版PDF文件（《育种实用统计学第12版》）尽管内容不全面，但可以参照。

2、软件育种专业性强：这是一款为育种工作服务的软件，软件中生物统计类试验设计及分析方法，数量遗传学分析方法都是围绕育种工作而设计。不是单纯的为了统计而统计。 单因素随机区组设计，间比法设计，格子设计，alpha-格子设计，增广设计等都是育种常用试验设计及数据分析方法；品种区域试验（一年多点、多年多点、RSD稳定性分析、品种性状综合评价、shukla模型稳定性分析、Eberhart-Russell稳定性分析，着眼育种中的品种布点品种推广；配合力分析（Griffing完全双列杂交4种方式，不完全双列杂交NCⅡ、不完全双列杂交NCⅡ多性状）、遗传力估计（广义，狭义）着眼育种中的材料选育，品种创制。

其中Griffing完全双列杂交4种分析方法 依据Griffing（1956）年发表论文开发，保证软件分析结果忠实原著。
AMMI模型分析开发，依据H.G.Gauch,Jr.著的 《产量区域试验统计分析---因子设计的AMMI分析》

3、配合力、育种值兼顾：选育材料，以玉米育种为例，采用配合力策略是个高效策略，BLUP育种值策略是更科学的育种策略，可以提升配合力计算的准确性，两种分析方法都提供给用户，是育种家软件的特色优势。

 

4、BLUP方法结合配合力：我们根据植物育种特点，参考Rex Bernardo教授及王健康老师介绍的模型，结合植物育种数据特点，提出了下述数学模型，更适合AB群模式育种使用。（2019.10.06）

   y =μ+ Xβ+ Ua + Wb + Zs + e

μ：试验数据均值
β：年度+地点的合并固定效应
a：A群一般配合力向量
b：B群一般配合力向量
s：测配组合A×B特殊配合力向量
e：剩余误差向量
X、U、W、Z为相应关联矩阵。

5、经验规则查询：经常有育种老师在咨询农博士育种家软件功能时向我们反映，随着育种年限和育种规模的不断增长，手头的育种材料从最初的几份、几十份慢慢增加到成百上千份……，如何快速准确的找出适合做母本的材料和适合做父本的材料，人工进行这样的工作太有挑战性了。实际育种中我们育种家的经验是不可或缺的，但是面对海量的种质材料筛选评价工作，育种家的精力又是有限的，如何将骨干/资深育种家的经验在团队内复制，从而实现规模化的精准育种决策，是育种软件需要具备的功能。

6、人工智能：神经网络可以进行有效的预测，我们尝试将其应用于育种领域，简单理解就是基于已有的育种数据积累（训练样本），来预测未知性状数据。举个简单的例子：手头有很多自交系材料，这些材料的性状值是有的，比如株高，抗病性，穗粗，产量等等性状值，现在正在改良中的一份新材料，其他性状数据都有了，就是产量数据还不知道，人工智能可以基于已有自交系性状数据，基于该材料已有性状数据，预测未知的产量数据。神经网络作为一种飞速发展的数据分析方法，其在育种中的应用还可以有很多很多。理论上讲，育种中凡是有数据积累，希望了解育种未来进展的任何环节都可以使用神经网络进行预测。

7、REML分析：REML（Restricted Maximum Likelihood）限制性最大似然估计英文首字母的缩写，也有称约束最大似然法，其主要功能是线性混合模型中的方差组分估计。
BLUP计算需要知道分析性状的加性遗传方差，因此在进行BLUP分析前，需要先用REML进行方差组分估计，或者采用经验值。REML是比BLUP更加复杂的计算过程。主要有两种计算方式，求导方式和非求导方式（如：DFREML算法）。NBSbreeding两种方式都提供支持。 （2019.9）

8、分子育种ssGBLUP分析：博思公司倡导植物育种中采用育种值用于育种选择，并依据常规育种系谱，在育种家软件中提供BLUP育种值分析方法，考虑客户现实需要，博思公司在育种家软件中新增加了ssGBLUP育种值计算分析功能。具备全基因组选择（GS）试验条件的用户，可以进行两种BLUP育种值计算分析，综合比较分析结果，为育种选择提供更准确的参考信息。ssGBLUP是全基因组选择（GS）中计算材料育种值的一种算法。ssGBLUP采用分子标记（SNP）信息建立试验材料间的亲缘关系G矩阵，相比依托育种系谱建立的加性遗传相关矩阵A，理论上更能准确的反应材料间的基因相似程度。ssGBLUP是传统BLUP育种值分析方法在分子育种领域的延伸。

9、多作物育种支持：一套软件可以管理多种作物同时育种。每种作物的育种性状可以自定义。采集器配套软件同步支持多作物，支持多任务同时采集。

10、品种稳定性分析支持：一年多点、多年多点、稳定性分析、品种性状综合评价、shukla模型稳定性分析、Eberhart-Russell稳定性分析、AMMI模型分析等多种稳定性分析方法，另外，提供更适合育种工作使用的RSD（相对平均偏差）。

    相对平均偏差（RSD，Relative Standard Deviation）可以度量稳定性试验中材料间的数据离散程度，比方差、Shukla方差度量分辨效果更好。为方便用户使用及比较，稳定性分析同时增加Shukla模型稳定性方法支持。
 1、相对平均偏差RSD应用于一个试验中品种间稳定性的比较；
 2、稳定性分析模型（Y=μ+年度效应+地点效应+积温效应+σ），应用于品种适宜推广地区的定位分析。
农博士育种家软件为育种后期，材料稳定性评价、品种适合推广区域定位提供专业统计分析支持。
查看相关文档：
相对平均偏差在品种稳定性分析中的作用.pdf
Eberhart-Russell模型、Shukla模型、相对平均偏差稳定性分析比较.pdf
   免费在线算RSD

11、育种产量相关性状结构指数：博思公司根据我国育种家工作需要，自行研制的育种应用指数，该指数实现了育种性状的综合数值化目标，指数的高低可以用于度量育种材料的产量潜力，是通过性状数值化描述育种材料产量潜力的新工具。

在线免费使用

玉米   小麦   水稻

12、α-Lattice(α-格子设计)试验设计及数据分析支持：α-格子试验设计，是当前国外育种企业采用的一种不完全区组试验设计，主要应用于育种过程中早、中期产量试验阶段的品种筛选。其采用的不完全区组的试验设计方式，提升了试验效率，降低了育种试验成本。与随机区组试验设计相比，在参试材料很多的情况下，随机区组的小区面积急剧扩大，地块地力差异，对试验本身产生了破坏性影响，或者可以表述为，试验设计的局部控制失灵。在不扩大试验地块面积的情况下，尽量多安排试验材料，这就是不完全区组试验设计的优越性。

 

 

 

农博士育种家软件 主要功能特点

• 1、提供griffing配合力分析，NCⅡ配合力分析，BLUP育种值分析，BLUP配合力分析等多种专业数量遗传学分析方法。将数量遗传学、生物统计学实用分析方法与育种数据分析相结合，在用户传统经验育种基础上，轻松导入及应用先进科学的育种分析方法。经验育种+配合力（育种值）育种，定性定量相结合，服务育种工作。

• 2、育种数据采集---管理---分析，一体化的大型育种软件系统。

• 3、集成移动设备，条码技术，提升数据采集效率，降低数据错误，方便育种工作。
  
  

• 4、数据分析方法多：试验设计、试验分析（单因素随机区组，两因素随机区组，简单格子设计，alpha-格子设计，增广设计等）、品种区域试验（一年多点、多年多点、稳定性分析、品种性状综合评价、shukla模型稳定性分析、Eberhart-Russell稳定性分析）、配合力分析（Griffing完全双列杂交4种方式，不完全双列杂交NCⅡ、不完全双列杂交NCⅡ多性状）、遗传力估计（广义，狭义）、聚类分析、关联分析、通径分析、数据拟合、PCA（主成分）分析、AMMI模型分析、BP神经网络分析、GGE双标图、Q-Q图等功能。

• 5、支持多作物育种，可自定义育种考察性状，目前已成功应用于玉米、小麦、水稻、谷子、高粱、番茄、西（甜）瓜、辣椒、油菜、甘蔗、花卉等30多种植物育种领域。

• 6、通过质量性状分级转换，将分级质量性状等同数量性状，一并参与数值计算，极大提升了育种数据利用价值。

• 7、调查文本数据与拍摄照片集成管理，看调查数据同时可看所拍摄照片。

• 8、照片导入，照片浏览管理维护，图像识别，植株特征识别提取，叶夹角、长宽比、高度、面积、周长、考种计数等功能。株型育种支持。采用微软SQLserver系列数据库，支持海量数据存储。

• 9、支持自交系选育管理，系谱动态生成。

• 10、支持杂交材料管理，支持系谱管理。

• 11、动态试验设计，对比法、间比法、完全随机、随机区组、条区、裂区、拉丁方，常用方差分析，配合力分析，一年多点，多年多点，遗传模型检验等育种分析方法。除此之外，并在数据管理环节内部直接集成诸多统计分析功能，使统计分析应用直接结合数据浏览，统计知识的育种指导应用简单直接，目前集成的统计功能主要有：
  A、质量性状次数分布（分布图）
  B、常用统计量自动计算（方差，标准差，变异系数，平均数等）
  C、质量性状分级显示
  D、品种评价 / 选择淘汰 / 关联度
  E、杂交组合试配（电脑上搞杂交，杂交组合预测）
  F、BLUP
  G、配合力分析
  

• 12、杂交组合鉴定管理，方便查看参配材料在组合中表现，看一份材料在所有参配组合的平均表现。

• 13、杂交组合预测功能，根据已有杂交组合数据，科学计算预测新组合生产表现，“在电脑上搞组合杂交”，优化育种计划，提高育种效率。

• 14、支持Internet环境下使用，异地远程数据实时汇总，特别适合在外地有育种点，在海南有加代基地，有合作单位承担试验报数据使用。

• 15、严密的人员权限管理，课题组或者育种组有权限制约实现数据共享，组长可授权查看组员数据，组员仅能查看自己的数据。可设置浏览权限，仅能浏览数据，不能更改数据。

• 16、育种服务器上的育种家移动采集模块可与移动采集设备无缝对接，工作人员田间采集数据可直接存储到育种服务器，只要有Internet上网连接的地方，都可随时提交采集数据。

• 17、采集数据任务化，育种负责人在育种家软件中定义采集任务，工作人员通过采集设备接收任务，采集完毕，上报数据。采集设备上可以直接定义任务。

• 18、移动育种数据采集＋条码扫描，是当今育种最先进工作模式，极大提高育种数据采集效率，高效、准确、可减轻育种工作人员的繁重工作，节省宝贵时间。

• 19、育种家软件注重育种数据保密性，无论是人员权限还是育种数据采集环节，这种保密性可传递到贵单位的整个育种技术体系。

• 20、农博士试验设计及统计分析系统（农博士统计软件）是育种家软件的一个子模块，统计软件的功能全部包括。

• 21、育种家软件支持单机使用，局域网C/S，广域网使用，软件伸缩性强，适应性广，数据可存储在用户自己的内部服务器上也支持云主机，云服务器。

• 22、软件购买后终身可以使用，无时间限制，免费服务期（通常为1年）满后，可享受优惠折扣进行软件版本升级。

• 23、我们将持续不断改进完善育种家软件，软件可按需定制、扩展，以更好满足育种用户使用需要。

• 目前，部分国家级、省级农科院所、农业高校和一批知名种业企业已成为育种家软件忠实用户。